Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EXOSC9Q06265 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EXOSC9Q06265 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms