Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HERVK_113P62684 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms