Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVK-21P61565 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms