Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
VSX2P58304 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VSX2P58304 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms