Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CTBP2P56545 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms