Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TAF6P49848 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF6P49848 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF6P49848 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms