Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJC1P36383 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GJC1P36383 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJC1P36383 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJC1P36383 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms