Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GJA4P35212 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GJA4P35212 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GJA4P35212 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms