Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRHP20396 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRHP20396 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRHP20396 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRHP20396 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRHP20396 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms