Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ITGB6P18564 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms