Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COL6A2P12110 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms