Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC192P0DO97 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms