Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM58BPP0C7Q3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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