Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms