Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPBD1B2RD01 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPBD1B2RD01 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms