Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP11Q9Y3A2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms