Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MED23Q9ULK4 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MED23Q9ULK4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms