Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms