Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MLH3Q9UHC1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms