Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms