Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms