Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LIN28AQ9H9Z2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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