Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP4Q9H6H4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms