Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SLIRPQ9GZT3 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms