Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
MAP1LC3CQ9BXW4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms