Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIN3AQ96ST3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms