Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CNBD2Q96M20 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNBD2Q96M20 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms