Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PROX1Q92786 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms