Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLIP4Q8N3C7 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLIP4Q8N3C7 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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