Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CCDC117Q8IWD4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CCDC117Q8IWD4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms