Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FUBP1-202ENST00000370767 2524 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
C16orf54Q6UWD8 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
C16orf54Q6UWD8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms