Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SLC38A7-215ENST00000570101 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NUMA1-233ENST00000616538 6998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RCAN1-214ENST00000620920 2257 ntTSL 4 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CRHR1-206ENST00000398285 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AC091078.1-202ENST00000543286 2012 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
C5orf47Q569G3 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms