Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 DLGAP3-201ENST00000235180 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 C22orf39-202ENST00000399562 3350 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
KRTAP25-1Q3LHN0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms