Protein–RNA interactions for Protein: Q16873

LTC4S, Leukotriene C4 synthase, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTC4SQ16873 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
LTC4SQ16873 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LTC4SQ16873 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms