Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SSX1Q16384 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SSX1Q16384 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms