Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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TRIP10Q15642 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIP10Q15642 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms