Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TAF11Q15544 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms