Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SS18Q15532 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18Q15532 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SS18Q15532 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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SS18Q15532 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
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SS18Q15532 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SS18Q15532 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SS18Q15532 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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