Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDK5R1Q15078 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDK5R1Q15078 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDK5R1Q15078 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CDK5R1Q15078 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CDK5R1Q15078 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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