Protein–RNA interactions for Protein: Q14541

HNF4G, Hepatocyte nuclear factor 4-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4GQ14541 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HNF4GQ14541 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HNF4GQ14541 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms