Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C1orf61Q13536 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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C1orf61Q13536 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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