Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BFSP2Q13515 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms