Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PLD1Q13393 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PLD1Q13393 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PLD1Q13393 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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PLD1Q13393 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PLD1Q13393 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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PLD1Q13393 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PLD1Q13393 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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