Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GRIK2Q13002 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GRIK2Q13002 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms