Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
IFFO1Q0D2I5 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFFO1Q0D2I5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms