Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ZNF85Q03923 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms