Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKP1P63208 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SKP1P63208 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms