Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB38P57729 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms