Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPAP53621 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPAP53621 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPAP53621 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms