Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SSR4P51571 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SSR4P51571 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SSR4P51571 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms